顺治经不起康熙的苦苦哀求，父子终于相认，而顺治亦将四十二章经的秘密告诉康熙，叮嘱他要做个好皇帝。
康熙在殿内参拜时，九难来刺杀他，幸得小宝舍命相救，被九难劫走。小宝为了脱身，再次利用刺杀鳌拜之事说服九难。适逢每年三月都是明崇祯的死忌，于是九难便带小宝去京城，上煤山拜祭崇祯。
康熙为半个月都未能找到小宝下落，怒责明珠、索额图等四人，更设定时限要他们办到。建宁无意中知道小宝出事，逼索额图等详细讲出，更向康熙透露自己喜欢小宝，要他尽法救小宝。
韦小宝传奇分集剧情介绍 第27集入皇宫，九难逼太后说出四十二章经的秘密，二人更大打出手，九难将太后的化骨绵掌转移到她身上，太后为了自救，说出她是明代后人毛东珠，真太后被她软禁。
九难发现四十二章经的封面内藏有细小羊皮，必须集齐八本才能并出完整地图。
九难带小宝来到崇祯陵墓，再返阿珂，九难知阿珂不喜欢小宝，故意处处维护小宝，令阿珂非常生气。
双儿四处寻找小宝不获，而小宝得知九难是阿珂的师父，对她照顾周到，深得九难喜爱。
韦小宝传奇分集剧情介绍 第28集小宝为求接近阿珂，请九难收他为徒，九难欣然答应。
巴颜带三名喇嘛围攻九难，逼她交出四十二章经，九难不敌幸得小宝略施小计，把三名喇嘛刺死，不过九难亦身受重伤。
小宝等人在途中巧遇克塽，克塽说自己是台湾郑家二公子，更邀请九难共同赴河间府出席“杀桂”大典。
不过，巴颜的师兄桑结追上九难，因九难伤势还未复原，于是小宝便在桑结的酒里落了蒙汗药，乘机逃走，但桑结亦步亦趋，终于九难等人不敌，小宝便将毒粉撒落在经书中，令桑结中毒，避过一劫。
韦小宝传奇分集剧情介绍 第29集小宝将化尸粉撒落经书上，桑结中毒后自断一臂离去。九难等人参加“杀桂”大典，推举各省盟主，陈近南则成为总盟主。
小宝与青木堂等人戏弄克塽，又乘机卖弄英雄救美本事。
多隆找到小宝，小宝借多隆之手欲除掉克塽得阿珂，多隆捉克塽并设计让小宝与阿珂成亲时，杨溢之等人扮“生藩”至，又提走了克塽，后得冯锡范救出，阿珂知道是小宝所为，更憎恨小宝。锡范言谈间开罪了九难，九难怒嘱小宝、阿珂不得再与克塽等人来往，并与二人回京。
韦小宝传奇分集剧情介绍 第30集多隆因赶路加上内伤，回皇宫后即晕倒，众人以为小宝已死，康熙等伤心拜祭。小宝回宫，众以为见鬼。
小宝向康熙提议借他人之手除三桂。
小宝与康熙借意搜太后寝宫，毛东珠落荒而逃，真太后获救。小宝乘机取走一本四十二章经及羊皮。
建宁因被赐婚嫁与吴应熊而大吵大闹，康熙派小宝做随行赐婚使，实则要他找回三桂的四十二章经。
锡范污蔑近南背叛郑王并下手暗算，小宝见近南不敌，暗中撒出石灰粉吓退锡范，天地会人劝近南及早脱离郑家及两公子之斗争。
